Přeshraniční charakter Česko-Bavorského Geoparku vyžaduje specifický management, jehož struktura se bude s rozvojem aktivit dále vyvíjet. V současné době existují tři nezávislá řídící centra, která úzce koordinují společnou činnost geoparku:
Na území Národního geoparku Egeria, tj. v okresech Cheb, Karlovy Vary, Sokolov v Karlovarském kraji, byla iniciativa zprvu vedena Nadací Georgia Agricoly, region Slavkovský les, a poté odborem regionálního rozvoje Krajského úřadu Karlovarského kraje v úzké spolupráci s Českou geologickou službou a dalšími organizacemi. V září 2006 byla zřízena pozice manažera geoparku při Krajském muzeu Sokolov, nyní Muzeu Sokolov, příspěvkové organizaci Karlovarského kraje.
Na území geoparku GeoLoci (okresy Tachov a obec Úterý) řídí aktivity geoparku obecně prospěšná společnost GeoLoci.
V Bavorsku byl vyhlášen Národní geopark Bayern-Böhmen. Zastupuje Koordinations- und Geschäftsstelle Geopark Bayern-Böhmen v Parksteinu, právnická osoba pověřená pracovní skupinou Bavorský geopark. Nově je založena obecně prospěšná společnost GEOPARK Bayern-Böhmen e. V.
Společný management Česko-Bavorského Geoparku je založen na periodické rotaci zástupců uvedených stran na mezinárodní i národní úrovni.
Česko-Bavorský Geopark v Karlovarském kraji
Národní geopark Egeria
Muzeum Sokolov, p.o. Karlovarského kraje
Zámecká 1
CZ-356 01 Sokolov
www.geopark.cz
e-mail: info@geopak.cz
Česko-Bavorský Geopark v Bavorsku
Nationaler Geopark Bayern-BöhmenKoordinations- und Geschäftsstelle
Marktplatz 1
D-92711 Parkstein
info@geopark-bayern.de
www.geopark.de
Česko-Bavorský Geopark v Plzeňském kraji
Národní geopark GeoLoci, o.p.s.
CZ-349 01 Svojšín 1
Karlovarský kraj – spolupráce na investičních projektech Geoparku Egeria
Nadace Georgia Agricoly, Region Slavkovský les – původní nositel projektu. Převod důležitých pozemků na Karlovarský kraj za účelem dalšího rozvoje infrastruktury na území Geoparku Egeria.
Agentura ochrany přírody a krajiny ČR – Správa CHKO Slavkovský les. Spolupráce v rámci aktivit a projektů spojených s CHKO Slavkovský les.
Správa přírodních léčivých zdrojů a kolonád Karlovy Vary – spolupráce na propagaci Geoparku Egeria
Klub českých turistů – spolupráce na propagaci geoparku a pomoc při monitoringu stavu lokalit a informačních tabulí.
Geopark spolupracuje i s Muzeem Cheb a s Muzeem Karlovy Vary a obcemi
Obec Rovná – spolupráce při vytváření zázemí pro důl Jeroným
Obec Lipová – spolupráce na zpřístupnění lokality Železná hůrka
Město Krásno - spolupráce při vytváření zázemí pro důl Jeroným, spolupráce na provozu Hornického muzea v Krásně
Město Horní Slavkov – finanční spoluúčast na muzeu v Horním Slavkově
Město Jáchymov – participace na zpřístupnění na otevření štoly č. 1 v Jáchymově včetně vytvoření zázemí pro štolu
Města, obce a soukromé subjekty, na jejichž pozemcích byly umístěny informační tabule – spolupráce na jejich monitoringu a kontrole
Česká geologická služba – spolupráce na propagaci Geoparku Egeria, poradenská činnost v oblasti geologie
Ministerstvo životního prostředí – poradenství v oblasti trvale udržitelného rozvoje a při získávání dotací ze EU nebo z MŽP
Diamo, s. p. – poradenství a spolupráce na provozu a zpřístupnění důlních děl (důl Jeroným, Štola č. 1 v Jáchymově)
Vysoká škola báňská – Technická univerzita Ostrava – Hornicko-geologická fakulta – spolupráce na propagaci a zajištění přístupnosti podzemních prostor
Forografie 1: Kamenné srdce v parku u Muzea Sokolov
Fotografie 2: Muzeum Sokolov
Fotografie 3: